La SNCF crée en 1957 sa société d'étude sous le nom de SOFRERAIL (Société française d’études et de réalisations ferroviaires), peu après en 1961 la RATP se dote elle aussi d'une société d'étude : SOFRETU (Société française d’études et de réalisations de transports urbains) ces deux entités fonctionneront séparément jusqu'en 1995. A cette date les deux sociétés fusionnent, et de cette fusion nait SYSTRA-Sofretu-Sofrerail, qui deviendra SYSTRA (contraction de "système de transport") en 1997. En 2012, SYSTRA comprend également INEXIA ET XELIS, respectivement filiales d'ingénieries de la SNCF et de la RATP.